Le Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique permet d’effectuer des recherches sur les effets des changements climatiques et du dégel du pergélisol sur la dynamique de mélange et la transparence de l’eau en milieu lacustre, et leurs multiples conséquences sur le réseau alimentaire microbien, les émissions de gaz à effet de serre et l’habitat oxythermique. Les recherches effectuées avec cette infrastructure portent également sur le développement d’outils optiques pour la détection précoce des fleurs d’eau d’algues et de cyanobactéries et autres problématiques liées au brunissement des eaux.
Ce laboratoire pilote offre à la communauté scientifique et à l’industrie son expertise multidisciplinaire et ses équipements de pointe pour le développement et la mise à l'échelle de procédés de fermentation ainsi que la récupération, la purification et la caractérisation de divers dérivés microbiens. Sa vocation première est la R&D dans le domaine des biotechnologies, et tout spécialement les produits à valeur ajoutée utilisant des résidus putrescibles comme matière première.
Le laboratoire de géophysique appliquée du département de géologie et de génie géologique comporte plusieurs équipements géophysiques pour l’auscultation non destructive des milieux physiques pour des besoins en sciences de la Terre. Ces équipements sont complétés par un système de poussée linéaire d’une capacité de 10000 kg pour réaliser des essais de pénétration au piézocône électro-sismique à taux de pénétration constant. Ces essais fournissent des renseignements précis mais ponctuels sur la stratigraphie du milieu étudié. Afin d’étendre cette stratigraphie à l’ensemble d’un site d’études donné, les méthodes géophysiques de surface d’auscultation des milieux physiques (profils de géoradar, tomographie 2D et 3D de polarisation provoquée, levés de sismique réfraction et réflexion, …) sont alors utilisées.
L’équipe bénéficie d’un laboratoire d’analyse comprenant les appareils suivants : Absorption atomique, Analyseur de carbone, Analyseurs de chlore en continu, Analyseurs de UV en continu, Analyseurs d’azote ammoniacal en continu, Analyseurs de turbidité en continu, Analyseur de particules, Chromatographe ionique, Chromatographes gazeux à détection à capture d’électron (GC-ECD), Chromatographe en phase gazeuse avec spectromètre de masse (GC-MS), Chromatographe en phase gazeuse avec spectromètre de masse en tandem (GC-MS-MS), Chromatographe en phase liquide ultraperformance (UPLC), Équipements pour la microbiologie moléculaire, Spectrophotomètre UV, Titrateur automatique, Identificateur de colonies, Cycleurs thermiques, Robot pour la préparation d’échantillons d’eau. L’équipe opère également divers montages expérimentaux et possède différents logiciels de simulation.
Le laboratoire est doté d’un cytomètre BD LSRFortessa à quatre lasers qui permet d'effectuer des analyses multiparamétriques de haut niveau pour caractériser des populations cellulaires. Un cytomètre BD FACS Calibur à deux lasers permet d’effectuer des analyses de routine telle l’expression de marqueurs de surface. Le système de microscopie confocale Zeiss LSM780 est quant à lui un instrument de pointe permettant l’étude de divers processus biologiques sur plans cellulaire et subcellulaire tels le « trafficking » intracellulaire et la localisation de molécules d’agents pathogènes.
Le laboratoire MiCEL se spécialise dans l’analyse moléculaire et métagénomique des communautés microbiennes présentes dans les infrastructures de gestion de l’eau.
Le laboratoire est capable de performer différentes analyses utilisant l’ADN et l’ARN présent dans les échantillons environnementaux incluant : l'exercice d'analyses et quantifications PCR (réaction de polymérisation en chaîne), la microscopie en fluorescence in situ Hybridization de l'ARN 16S (FISH), le séquençage à haut débit d’amplicons pour analyser la diversité phylogénétique et fonctionnelle des communautés, ainsi que le séquençage métagénomique (shotgun sequencing).
Le LIASHyC vise à être une référence mondiale dans le domaine des systèmes hydrogéologiques complexes grâce à la qualité et à la pertinence de ses travaux de recherche et d’innovation, de formation et de ses activités de transfert. Le programme de recherche et d’innovation porta sur l’hydrogéologie des milieux fissurés, l’hydrogéologie des régions nordiques et alpines, ainsi que sur la caractérisation des hétérogénéités hydrogéologiques. Le LIASHyC est constitué des parties suivantes :
- Institut des sciences de la Terre de l’UNIL (ISTE-UNIL)
- Centre d’Hydrogéologie et de Géothermie de l’UNINE (CHYN-UNINE)
- Centre Eau Terre Environnement de l’INRS
- Département de géologie et de génie géologique de l’Université Laval
La recherche réalisée au Laboratoire ouvert de géothermie (LOG) permet une meilleure compréhension des phénomènes souterrains de transfert de chaleur et d’écoulement diminuant les risques technologiques en géothermie. L'accès au laboratoire est « ouvert », inspiré de la philosophie des logiciels libres.
Ces laboratoires permettent d’analyser des échantillons d’eau par colorimétrie, fluorométrie, spectroscopie, radioisotopie et chromatographie, ainsi que d’analyser les composés organiques et les métaux traces présents dans différentes matrices (eau, effluents, boues d’épuration, sols, sédiments, tissus biologiques), et enfin, d’analyser les éléments présents dans des échantillons solides (roches, sols, sédiments, boues). Scanographie par microfluorescence X : Analyses non destructives par radiographie couplées à l’analyse chimique par microfluorescence X de roches, de sols et de sédiments. Microscopie électronique à balayage : Production d’images en haute résolution de la surface et de la composition d’un échantillon à l’aide d’une technologie utilisant les interactions électrons-matière.
Le service est en mesure de répondre à plusieurs besoins dans les domaines animal, végétal ou microbien, notamment :
• Recherche et identification de virus de toutes provenances ;
• Recherche et identification (Gram positif ou Gram négatif) et description de bactéries de toutes provenances
• Recherche et identification de contaminants (ex. : mycoplasmes) dans des échantillons cliniques ou des cultures cellulaires
• Immuno-électromicroscopie avec ou sans or colloïdal sur un échantillon liquide (coloration négative) ou sur des coupes cellulaires (techniques de pré- ou de post-enrobage)
• Contrôle de qualité de fractions virales de gradients de densité
• Morphologie cellulaire sur coupes minces
• Quantification de virus (ex. : Retrovirus) à l'aide de sphères de latex à concentration connue par coloration négative.
• Contrôle de qualité des produits biologiques rejetés à l'égoût municipal
• Recherche de Retrovirus dans des cellules, identification et compte de la proportion des cellules (coupes cellulaires) infectées
